La Junta Directiva es el órgano ejecutivo de la Escuela Infantil Fundación Umeak. Se compone de 7 miembros, 6 de los cuales representan a las madres y padres y 1 al personal docente. Entre sus funciones están la administración del presupuesto, la elaboración del Calendario Escolar, la planificación del curso, la elaboración del balance y la tenencia y mantenimiento de los libros oficiales. La Junta es el órgano legal de la Fundación Umeak a efectos de selección y contratación de personal y representa a la escuela ante la UPV/EHU y demás organismos exteriores.

La Junta Directiva actúa a modo de comisión permanente de la Asamblea General de Padres y Madres, ante la cual rinde cuentas de su actuación. Se reúne periódicamente y la duración de su mandato es de un año, siendo posible la elección por una sola vez.